大雄一行人在空地上聆听着出木杉叙述小说《金银岛》的情节,而大雄却睡着了,并梦见自己成为海盗。在地震的摇晃后,大雄从梦中醒来,并扬言去寻找真正的金银岛,不料却遭到胖虎和小夫的嘲笑。「我一定会找到金银岛!」大雄这样对胖虎声明,并答应如果失败了,就用鼻子吃卡邦尼意粉。大雄知道自己夸下海口,便向哆啦A梦求救,之后使用道具「寻宝地图」寻找金银岛。然而地图指示出来的位置,居然是太平洋上莫名冒出来的新岛屿......。大雄一行人乘搭名为「大雄奥拉号」的船前往金银岛,就在即将靠岸时,一群海盗突然来袭。面对突然现身的敌人,大雄与他们陷入一阵苦战。不久后,金银岛竟然沉入海底,而静香亦突然被抓到海盗船上一同沉入海底。海盗们逃走后,大雄他们遇到一名在海上漂流的少年「弗洛克」和一只名叫「谜题」的机械鹦鹉。弗洛克自称是从海盗船逃出来的机械工,并且知道金银岛隐藏的重要秘密,原来那座岛是一艘高速运行的海盗船,用23世纪的高科技制成,一边穿梭于过去、现在、未来,一边攫取沉睡在海底的宝藏。大雄一行人决心要救出静香,而弗洛克亦担忧此时正在海盗船上的妹妹「莎菈」。与此同时,海盗船正在高速运行,而静香则被带到一个房间,并遇见莎菈,静香发现二人长相一模一样,只是头发颜色不同。在这种特别的缘份下,二人成了好朋友。莎菈更帮助静香隐藏身分,以免被其他海盗发现。静香在莎菈的帮助下,到岛上的食堂工作。在厨房里,静香发现法式土司在这家餐厅非常有人气,莎菈透露这是她的母亲教她做的,是餐厅的招牌菜。但当静香问及莎菈母亲现时的状况时,莎菈则说她的母亲费欧娜已在5年前(实际是2254年)过世,静香连声道歉。莎菈接着说她的母亲是一名伟大的科学家,尽管工作很忙,但是一回家,就会给她和哥哥做法式土司。静香从中得知莎菈的哥哥(弗洛克)离开了海盗船,被问及原因,莎菈则说她的哥哥一直和父亲合不来,总想着有一天一定要离开这里。静香从莎菈哥哥的意气用事联想到大雄在空地曾信誓旦旦许下「用鼻子吃卡邦尼意粉」的诺言,认为大雄逞这种威风实在是没意义,并将此事告诉莎菈,二人同时哈哈大笑,令双方友情更加深厚...